Centrum Medycyny Translacyjnej SGGW posiada pomieszczenia o podwyższonym standardzie czystości tzw. Clean Room, w których dzięki odpowiednio zaprojektowanej kaskadzie ciśnień powstaje środowisko pracy z ograniczonym do minimum powstawaniem i gromadzeniem się zanieczyszczeń (kurz, pył, mikroorganizmy itp.). W tej strefie oprócz laboratoriów do prowadzenia hodowli komórkowych znajduje się pomieszczenie z wysokiej klasy urządzeniami tj.: odwrócony superrozdzielczy mikroskop konfokalny z technologią „spinning disc” wyposażony: w moduły kontroli parametrów środowiskowych (temperatura, stężenie gazów) do obrazowań przyżyciowych oraz dwie kamery do równoczesnego obrazowania w dwóch kanałach (SpinSR10 z systemem IXplore, Olimpus), zautomatyzowany system do analizy/oceny żywych komórek oferujący szereg zastosowań począwszy od obrazowania po analizy kinetyczne a wszystko to w ściśle kontrolowanych warunkach środowiskowych (BioSpa Live Cell Analysis System, Bio-Tek) czy też system do mikrodysekcji umożliwiający dysekcję szerokiej gamy próbek biologicznych z materiału pochodzenia zwierzęcego/ludzkiego, roślinnego oraz bakteryjnego, z którego może być następnie izolowany materiał do badań genomicznych (DNA, sekwencjonowanie), transkryptomicznych (mRNA, miRNA) czy proteomicznych, (Laser Microdissection Microscopes LMD7, Leica).